Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk3aQ9JKX8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms