Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chrac1Q9JKP8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chrac1Q9JKP8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms