Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nova1Q9JKN6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms