Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trem3Q9JKE1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms