Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Msgn1Q9JK54 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms