Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJL8

Sars2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

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Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sars2Q9JJL8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sars2Q9JJL8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sars2Q9JJL8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sars2Q9JJL8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sars2Q9JJL8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sars2Q9JJL8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms