Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cacna1fQ9JIS7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cacna1fQ9JIS7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms