Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pus3Q9JI38 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms