Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tcirg1Q9JHF5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tcirg1Q9JHF5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms