Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfcp2Q9ERA0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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