Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn2Q9ER65 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn2Q9ER65 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms