Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps35Q9EQH3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms