Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r47Q9EQ51 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmn1r47Q9EQ51 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms