Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfrsf21Q9EPU5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf21Q9EPU5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms