Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf1Q9EPU4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpsf1Q9EPU4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms