Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clstn1Q9EPL2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Clstn1Q9EPL2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms