Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnft1Q9DCN7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnft1Q9DCN7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms