Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tspan4Q9DCK3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Tspan4Q9DCK3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Tspan4Q9DCK3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan4Q9DCK3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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