Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pop7Q9DCH2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pop7Q9DCH2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms