Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Xab2Q9DCD2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Xab2Q9DCD2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms