Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf6Q9DBU5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf6Q9DBU5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms