Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBP5

Cmpk1, UMP-CMP kinase, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk1Q9DBP5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmpk1Q9DBP5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmpk1Q9DBP5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms