Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med27Q9DB40 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms