Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc89Q9DA73 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc89Q9DA73 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms