Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmem239Q9DA47 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmem239Q9DA47 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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