Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samd8Q9DA37 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samd8Q9DA37 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms