Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sgf29Q9DA08 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms