Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efhc1Q9D9T8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efhc1Q9D9T8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms