Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp12Q9D9M2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp12Q9D9M2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Usp12Q9D9M2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp12Q9D9M2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp12Q9D9M2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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