Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N2

Fam45a, Protein FAM45A, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam45aQ9D8N2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam45aQ9D8N2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam45aQ9D8N2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms