Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capns2Q9D7J7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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