Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc94Q9D6J3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc94Q9D6J3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms