Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cmtm5Q9D6G9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms