Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms