Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gabra4Q9D6F4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gabra4Q9D6F4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gabra4Q9D6F4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gabra4Q9D6F4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gabra4Q9D6F4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gabra4Q9D6F4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gabra4Q9D6F4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gabra4Q9D6F4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gabra4Q9D6F4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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