Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Ttc9bQ9D6E4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc9bQ9D6E4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms