Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
4930513O06RikQ9D549 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4930513O06RikQ9D549 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms