Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phf6Q9D4J7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms