Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrp2bpQ9D4C6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms