Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms