Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed11Q9D2R4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed11Q9D2R4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms