Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spns3Q9D232 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spns3Q9D232 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spns3Q9D232 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spns3Q9D232 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spns3Q9D232 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spns3Q9D232 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spns3Q9D232 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spns3Q9D232 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Spns3Q9D232 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms