Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc47Q9D024 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc47Q9D024 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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