Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MtrexQ9CZU3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms