Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nde1Q9CZA6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nde1Q9CZA6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms