Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mrpl55Q9CZ83 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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