Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mis12Q9CY25 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms