Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx7Q9CY18 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms