Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Prdm5Q9CXE0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm5Q9CXE0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm5Q9CXE0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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