Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MINDY3Q9CV28 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MINDY3Q9CV28 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms